A pesquisa de metadados no Catálogo SNIG é feita através de um formulário que permite conjugar a pesquisa de texto livre, extensão geográfica, extensão temporal, categoria temática, tipo de recurso e ponto de contacto do recurso.
Outra forma de pesquisar o catálogo é através dos recursos indexados no portal.
O catálogo de metadados do SNIG é ainda pesquisável através de aplicações externas que utilizam os dois tipos de serviços de catálogo disponíveis no SNIG (serviços de pesquisa do Geoportal 9.3.1), um baseado em protocolo REST (REpresentational State Transfer) e o outro conforme a especificação CSW (Catalog Service for Web) 2.02 OGC Core.